Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Setd1bQ8CFT2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Setd1bQ8CFT2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
Setd1bQ8CFT2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Setd1bQ8CFT2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Setd1bQ8CFT2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Setd1bQ8CFT2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
Setd1bQ8CFT2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Setd1bQ8CFT2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Setd1bQ8CFT2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Setd1bQ8CFT2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Setd1bQ8CFT2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
Setd1bQ8CFT2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Setd1bQ8CFT2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Setd1bQ8CFT2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Setd1bQ8CFT2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Setd1bQ8CFT2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Setd1bQ8CFT2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
Setd1bQ8CFT2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Setd1bQ8CFT2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Setd1bQ8CFT2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Setd1bQ8CFT2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Setd1bQ8CFT2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Setd1bQ8CFT2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Setd1bQ8CFT2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Setd1bQ8CFT2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Setd1bQ8CFT2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Setd1bQ8CFT2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Setd1bQ8CFT2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Setd1bQ8CFT2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Setd1bQ8CFT2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Setd1bQ8CFT2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Setd1bQ8CFT2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Setd1bQ8CFT2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Setd1bQ8CFT2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Setd1bQ8CFT2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Setd1bQ8CFT2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Setd1bQ8CFT2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Setd1bQ8CFT2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Setd1bQ8CFT2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Setd1bQ8CFT2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Setd1bQ8CFT2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Setd1bQ8CFT2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Setd1bQ8CFT2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Setd1bQ8CFT2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Setd1bQ8CFT2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Setd1bQ8CFT2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Setd1bQ8CFT2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Setd1bQ8CFT2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Setd1bQ8CFT2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Setd1bQ8CFT2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
Setd1bQ8CFT2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Setd1bQ8CFT2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Setd1bQ8CFT2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Setd1bQ8CFT2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Setd1bQ8CFT2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Setd1bQ8CFT2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
Setd1bQ8CFT2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Setd1bQ8CFT2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Setd1bQ8CFT2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
Setd1bQ8CFT2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Setd1bQ8CFT2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Setd1bQ8CFT2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Setd1bQ8CFT2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Setd1bQ8CFT2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Setd1bQ8CFT2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Setd1bQ8CFT2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Setd1bQ8CFT2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Setd1bQ8CFT2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Setd1bQ8CFT2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Setd1bQ8CFT2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Setd1bQ8CFT2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Setd1bQ8CFT2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Setd1bQ8CFT2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
Setd1bQ8CFT2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Setd1bQ8CFT2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Setd1bQ8CFT2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Setd1bQ8CFT2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Setd1bQ8CFT2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Setd1bQ8CFT2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Setd1bQ8CFT2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Setd1bQ8CFT2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Setd1bQ8CFT2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
Setd1bQ8CFT2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Setd1bQ8CFT2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Setd1bQ8CFT2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Setd1bQ8CFT2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Setd1bQ8CFT2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Setd1bQ8CFT2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms