Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc17Q8CE13 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc17Q8CE13 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc17Q8CE13 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc17Q8CE13 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc17Q8CE13 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc17Q8CE13 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc17Q8CE13 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc17Q8CE13 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc17Q8CE13 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc17Q8CE13 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc17Q8CE13 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc17Q8CE13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc17Q8CE13 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc17Q8CE13 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc17Q8CE13 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc17Q8CE13 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc17Q8CE13 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc17Q8CE13 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc17Q8CE13 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc17Q8CE13 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc17Q8CE13 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc17Q8CE13 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc17Q8CE13 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc17Q8CE13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc17Q8CE13 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc17Q8CE13 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc17Q8CE13 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc17Q8CE13 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc17Q8CE13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc17Q8CE13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc17Q8CE13 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc17Q8CE13 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc17Q8CE13 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc17Q8CE13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc17Q8CE13 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc17Q8CE13 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc17Q8CE13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc17Q8CE13 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc17Q8CE13 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc17Q8CE13 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc17Q8CE13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc17Q8CE13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc17Q8CE13 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc17Q8CE13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc17Q8CE13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc17Q8CE13 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc17Q8CE13 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc17Q8CE13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc17Q8CE13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc17Q8CE13 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc17Q8CE13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc17Q8CE13 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc17Q8CE13 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc17Q8CE13 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc17Q8CE13 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.1 ms