Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDC7

Zbtb9, Zinc finger and BTB domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb9Q8CDC7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Zbtb9Q8CDC7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Zbtb9Q8CDC7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Zbtb9Q8CDC7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Zbtb9Q8CDC7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Zbtb9Q8CDC7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Zbtb9Q8CDC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Zbtb9Q8CDC7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Zbtb9Q8CDC7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Zbtb9Q8CDC7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Zbtb9Q8CDC7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Zbtb9Q8CDC7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Zbtb9Q8CDC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Zbtb9Q8CDC7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Zbtb9Q8CDC7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Zbtb9Q8CDC7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Zbtb9Q8CDC7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Zbtb9Q8CDC7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Zbtb9Q8CDC7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Zbtb9Q8CDC7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Zbtb9Q8CDC7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Zbtb9Q8CDC7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Zbtb9Q8CDC7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Zbtb9Q8CDC7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Zbtb9Q8CDC7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Zbtb9Q8CDC7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Zbtb9Q8CDC7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Zbtb9Q8CDC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Zbtb9Q8CDC7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Zbtb9Q8CDC7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Zbtb9Q8CDC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Zbtb9Q8CDC7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Zbtb9Q8CDC7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Zbtb9Q8CDC7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Zbtb9Q8CDC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Zbtb9Q8CDC7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Zbtb9Q8CDC7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Zbtb9Q8CDC7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Zbtb9Q8CDC7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Zbtb9Q8CDC7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Zbtb9Q8CDC7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Zbtb9Q8CDC7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Zbtb9Q8CDC7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Zbtb9Q8CDC7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Zbtb9Q8CDC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Zbtb9Q8CDC7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Zbtb9Q8CDC7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Zbtb9Q8CDC7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Zbtb9Q8CDC7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Zbtb9Q8CDC7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Zbtb9Q8CDC7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Zbtb9Q8CDC7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Zbtb9Q8CDC7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Zbtb9Q8CDC7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Zbtb9Q8CDC7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Zbtb9Q8CDC7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Zbtb9Q8CDC7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Zbtb9Q8CDC7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Zbtb9Q8CDC7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Zbtb9Q8CDC7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Zbtb9Q8CDC7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Zbtb9Q8CDC7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Zbtb9Q8CDC7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Zbtb9Q8CDC7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Zbtb9Q8CDC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Zbtb9Q8CDC7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Zbtb9Q8CDC7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Zbtb9Q8CDC7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Zbtb9Q8CDC7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,9 ms