Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc15Q8C9M2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc15Q8C9M2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc15Q8C9M2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc15Q8C9M2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc15Q8C9M2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc15Q8C9M2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc15Q8C9M2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc15Q8C9M2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc15Q8C9M2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc15Q8C9M2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc15Q8C9M2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc15Q8C9M2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc15Q8C9M2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc15Q8C9M2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc15Q8C9M2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc15Q8C9M2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc15Q8C9M2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc15Q8C9M2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc15Q8C9M2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc15Q8C9M2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc15Q8C9M2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc15Q8C9M2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc15Q8C9M2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc15Q8C9M2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc15Q8C9M2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc15Q8C9M2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc15Q8C9M2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc15Q8C9M2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc15Q8C9M2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc15Q8C9M2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc15Q8C9M2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc15Q8C9M2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc15Q8C9M2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc15Q8C9M2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc15Q8C9M2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc15Q8C9M2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc15Q8C9M2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc15Q8C9M2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc15Q8C9M2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc15Q8C9M2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc15Q8C9M2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc15Q8C9M2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc15Q8C9M2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc15Q8C9M2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc15Q8C9M2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc15Q8C9M2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc15Q8C9M2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc15Q8C9M2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc15Q8C9M2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc15Q8C9M2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc15Q8C9M2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc15Q8C9M2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc15Q8C9M2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc15Q8C9M2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms