Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ythdf3Q8BYK6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ythdf3Q8BYK6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ythdf3Q8BYK6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ythdf3Q8BYK6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ythdf3Q8BYK6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdf3Q8BYK6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdf3Q8BYK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdf3Q8BYK6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdf3Q8BYK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdf3Q8BYK6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdf3Q8BYK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdf3Q8BYK6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdf3Q8BYK6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdf3Q8BYK6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdf3Q8BYK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdf3Q8BYK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdf3Q8BYK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdf3Q8BYK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdf3Q8BYK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdf3Q8BYK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdf3Q8BYK6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdf3Q8BYK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdf3Q8BYK6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdf3Q8BYK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdf3Q8BYK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdf3Q8BYK6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdf3Q8BYK6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ythdf3Q8BYK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdf3Q8BYK6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdf3Q8BYK6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdf3Q8BYK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdf3Q8BYK6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdf3Q8BYK6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdf3Q8BYK6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdf3Q8BYK6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdf3Q8BYK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdf3Q8BYK6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms