Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmd3Q8BHD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmd3Q8BHD4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Frmd3Q8BHD4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmd3Q8BHD4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmd3Q8BHD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmd3Q8BHD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmd3Q8BHD4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmd3Q8BHD4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmd3Q8BHD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmd3Q8BHD4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmd3Q8BHD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmd3Q8BHD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmd3Q8BHD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmd3Q8BHD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmd3Q8BHD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmd3Q8BHD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmd3Q8BHD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmd3Q8BHD4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmd3Q8BHD4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmd3Q8BHD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmd3Q8BHD4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmd3Q8BHD4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmd3Q8BHD4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmd3Q8BHD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmd3Q8BHD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmd3Q8BHD4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmd3Q8BHD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmd3Q8BHD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmd3Q8BHD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmd3Q8BHD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmd3Q8BHD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Frmd3Q8BHD4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmd3Q8BHD4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmd3Q8BHD4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmd3Q8BHD4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmd3Q8BHD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmd3Q8BHD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmd3Q8BHD4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmd3Q8BHD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmd3Q8BHD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmd3Q8BHD4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmd3Q8BHD4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmd3Q8BHD4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmd3Q8BHD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Frmd3Q8BHD4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmd3Q8BHD4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmd3Q8BHD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmd3Q8BHD4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmd3Q8BHD4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmd3Q8BHD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmd3Q8BHD4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmd3Q8BHD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms