Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pknox2Q8BG99 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pknox2Q8BG99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Pknox2Q8BG99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pknox2Q8BG99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pknox2Q8BG99 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pknox2Q8BG99 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pknox2Q8BG99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pknox2Q8BG99 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pknox2Q8BG99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Pknox2Q8BG99 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pknox2Q8BG99 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pknox2Q8BG99 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pknox2Q8BG99 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pknox2Q8BG99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pknox2Q8BG99 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pknox2Q8BG99 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pknox2Q8BG99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pknox2Q8BG99 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pknox2Q8BG99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pknox2Q8BG99 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pknox2Q8BG99 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pknox2Q8BG99 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pknox2Q8BG99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pknox2Q8BG99 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pknox2Q8BG99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pknox2Q8BG99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pknox2Q8BG99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pknox2Q8BG99 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pknox2Q8BG99 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pknox2Q8BG99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pknox2Q8BG99 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pknox2Q8BG99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pknox2Q8BG99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pknox2Q8BG99 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pknox2Q8BG99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pknox2Q8BG99 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms