Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcl2Q78Y63 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcl2Q78Y63 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcl2Q78Y63 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcl2Q78Y63 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcl2Q78Y63 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcl2Q78Y63 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcl2Q78Y63 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcl2Q78Y63 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcl2Q78Y63 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcl2Q78Y63 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcl2Q78Y63 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcl2Q78Y63 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcl2Q78Y63 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcl2Q78Y63 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pdcl2Q78Y63 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcl2Q78Y63 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcl2Q78Y63 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdcl2Q78Y63 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdcl2Q78Y63 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdcl2Q78Y63 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdcl2Q78Y63 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdcl2Q78Y63 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdcl2Q78Y63 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcl2Q78Y63 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcl2Q78Y63 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcl2Q78Y63 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdcl2Q78Y63 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcl2Q78Y63 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcl2Q78Y63 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcl2Q78Y63 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcl2Q78Y63 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcl2Q78Y63 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcl2Q78Y63 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcl2Q78Y63 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdcl2Q78Y63 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdcl2Q78Y63 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcl2Q78Y63 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcl2Q78Y63 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcl2Q78Y63 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcl2Q78Y63 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcl2Q78Y63 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcl2Q78Y63 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcl2Q78Y63 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcl2Q78Y63 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcl2Q78Y63 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms