Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scgb2b2Q6UGQ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b2Q6UGQ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b2Q6UGQ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b2Q6UGQ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scgb2b2Q6UGQ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scgb2b2Q6UGQ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scgb2b2Q6UGQ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scgb2b2Q6UGQ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scgb2b2Q6UGQ3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scgb2b2Q6UGQ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scgb2b2Q6UGQ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scgb2b2Q6UGQ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scgb2b2Q6UGQ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scgb2b2Q6UGQ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scgb2b2Q6UGQ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scgb2b2Q6UGQ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms