Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CtifQ6PEE2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CtifQ6PEE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CtifQ6PEE2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CtifQ6PEE2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CtifQ6PEE2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CtifQ6PEE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CtifQ6PEE2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CtifQ6PEE2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CtifQ6PEE2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CtifQ6PEE2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CtifQ6PEE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CtifQ6PEE2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CtifQ6PEE2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CtifQ6PEE2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CtifQ6PEE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CtifQ6PEE2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CtifQ6PEE2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CtifQ6PEE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CtifQ6PEE2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CtifQ6PEE2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CtifQ6PEE2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CtifQ6PEE2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CtifQ6PEE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CtifQ6PEE2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CtifQ6PEE2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CtifQ6PEE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CtifQ6PEE2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CtifQ6PEE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CtifQ6PEE2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CtifQ6PEE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CtifQ6PEE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CtifQ6PEE2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CtifQ6PEE2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CtifQ6PEE2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CtifQ6PEE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CtifQ6PEE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CtifQ6PEE2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CtifQ6PEE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CtifQ6PEE2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CtifQ6PEE2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CtifQ6PEE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CtifQ6PEE2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CtifQ6PEE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CtifQ6PEE2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CtifQ6PEE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CtifQ6PEE2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CtifQ6PEE2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CtifQ6PEE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CtifQ6PEE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CtifQ6PEE2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CtifQ6PEE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CtifQ6PEE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CtifQ6PEE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CtifQ6PEE2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CtifQ6PEE2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CtifQ6PEE2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CtifQ6PEE2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CtifQ6PEE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CtifQ6PEE2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CtifQ6PEE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CtifQ6PEE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CtifQ6PEE2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CtifQ6PEE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms