Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Trim37Q6PCX9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Trim37Q6PCX9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Trim37Q6PCX9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Trim37Q6PCX9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Trim37Q6PCX9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim37Q6PCX9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Trim37Q6PCX9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Trim37Q6PCX9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Trim37Q6PCX9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Trim37Q6PCX9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Trim37Q6PCX9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Trim37Q6PCX9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trim37Q6PCX9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trim37Q6PCX9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trim37Q6PCX9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Trim37Q6PCX9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Trim37Q6PCX9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Trim37Q6PCX9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trim37Q6PCX9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Trim37Q6PCX9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trim37Q6PCX9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trim37Q6PCX9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trim37Q6PCX9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Trim37Q6PCX9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Trim37Q6PCX9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trim37Q6PCX9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trim37Q6PCX9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Trim37Q6PCX9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Trim37Q6PCX9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Trim37Q6PCX9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Trim37Q6PCX9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Trim37Q6PCX9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trim37Q6PCX9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Trim37Q6PCX9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trim37Q6PCX9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trim37Q6PCX9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trim37Q6PCX9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trim37Q6PCX9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Trim37Q6PCX9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Trim37Q6PCX9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Trim37Q6PCX9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Trim37Q6PCX9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Trim37Q6PCX9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Trim37Q6PCX9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Trim37Q6PCX9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Trim37Q6PCX9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Trim37Q6PCX9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Trim37Q6PCX9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Trim37Q6PCX9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Trim37Q6PCX9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Trim37Q6PCX9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Trim37Q6PCX9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Trim37Q6PCX9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Trim37Q6PCX9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Trim37Q6PCX9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Trim37Q6PCX9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Trim37Q6PCX9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Trim37Q6PCX9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Trim37Q6PCX9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Trim37Q6PCX9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Trim37Q6PCX9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Trim37Q6PCX9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Trim37Q6PCX9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Trim37Q6PCX9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Trim37Q6PCX9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Trim37Q6PCX9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Trim37Q6PCX9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Trim37Q6PCX9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,7 ms