Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Pprc1Q6NZN1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Pprc1Q6NZN1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Pprc1Q6NZN1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Pprc1Q6NZN1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Pprc1Q6NZN1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Pprc1Q6NZN1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Pprc1Q6NZN1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Pprc1Q6NZN1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Pprc1Q6NZN1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Pprc1Q6NZN1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Pprc1Q6NZN1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Pprc1Q6NZN1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Pprc1Q6NZN1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Pprc1Q6NZN1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Pprc1Q6NZN1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Pprc1Q6NZN1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Pprc1Q6NZN1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Pprc1Q6NZN1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Pprc1Q6NZN1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Pprc1Q6NZN1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Pprc1Q6NZN1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Pprc1Q6NZN1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Pprc1Q6NZN1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Pprc1Q6NZN1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Pprc1Q6NZN1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Pprc1Q6NZN1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Pprc1Q6NZN1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Pprc1Q6NZN1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Pprc1Q6NZN1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Pprc1Q6NZN1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Pprc1Q6NZN1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Pprc1Q6NZN1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Pprc1Q6NZN1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Pprc1Q6NZN1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Pprc1Q6NZN1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Pprc1Q6NZN1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Pprc1Q6NZN1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Pprc1Q6NZN1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
Pprc1Q6NZN1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
Pprc1Q6NZN1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Pprc1Q6NZN1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Pprc1Q6NZN1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Pprc1Q6NZN1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Pprc1Q6NZN1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Pprc1Q6NZN1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Pprc1Q6NZN1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Pprc1Q6NZN1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
Pprc1Q6NZN1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Pprc1Q6NZN1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Pprc1Q6NZN1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
Pprc1Q6NZN1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Pprc1Q6NZN1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Pprc1Q6NZN1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Pprc1Q6NZN1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Pprc1Q6NZN1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Pprc1Q6NZN1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Pprc1Q6NZN1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Pprc1Q6NZN1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Pprc1Q6NZN1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Pprc1Q6NZN1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Pprc1Q6NZN1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
Pprc1Q6NZN1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Pprc1Q6NZN1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Pprc1Q6NZN1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Pprc1Q6NZN1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Pprc1Q6NZN1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Pprc1Q6NZN1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Pprc1Q6NZN1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Pprc1Q6NZN1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Pprc1Q6NZN1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Pprc1Q6NZN1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Pprc1Q6NZN1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Pprc1Q6NZN1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Pprc1Q6NZN1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Pprc1Q6NZN1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Pprc1Q6NZN1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Pprc1Q6NZN1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Pprc1Q6NZN1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Pprc1Q6NZN1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Pprc1Q6NZN1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Pprc1Q6NZN1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Pprc1Q6NZN1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Pprc1Q6NZN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Pprc1Q6NZN1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms