Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep290Q6A078 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep290Q6A078 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cep290Q6A078 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cep290Q6A078 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep290Q6A078 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep290Q6A078 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep290Q6A078 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep290Q6A078 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cep290Q6A078 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep290Q6A078 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep290Q6A078 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep290Q6A078 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep290Q6A078 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep290Q6A078 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep290Q6A078 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Cep290Q6A078 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Cep290Q6A078 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cep290Q6A078 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cep290Q6A078 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cep290Q6A078 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep290Q6A078 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep290Q6A078 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep290Q6A078 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep290Q6A078 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep290Q6A078 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cep290Q6A078 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep290Q6A078 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep290Q6A078 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep290Q6A078 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cep290Q6A078 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cep290Q6A078 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cep290Q6A078 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cep290Q6A078 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cep290Q6A078 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cep290Q6A078 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep290Q6A078 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cep290Q6A078 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep290Q6A078 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep290Q6A078 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cep290Q6A078 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep290Q6A078 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep290Q6A078 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep290Q6A078 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cep290Q6A078 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep290Q6A078 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cep290Q6A078 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cep290Q6A078 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep290Q6A078 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep290Q6A078 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep290Q6A078 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep290Q6A078 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep290Q6A078 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cep290Q6A078 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep290Q6A078 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep290Q6A078 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep290Q6A078 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cep290Q6A078 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep290Q6A078 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep290Q6A078 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep290Q6A078 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep290Q6A078 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep290Q6A078 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep290Q6A078 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep290Q6A078 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep290Q6A078 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep290Q6A078 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep290Q6A078 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep290Q6A078 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep290Q6A078 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep290Q6A078 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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