Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,05■■■■■ 4,64
Samd9lQ69Z37 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC44,05■■■■■ 4,64
Samd9lQ69Z37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,03■■■■■ 4,64
Samd9lQ69Z37 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,03■■■■■ 4,64
Samd9lQ69Z37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC44,01■■■■■ 4,64
Samd9lQ69Z37 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Samd9lQ69Z37 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC43,92■■■■■ 4,62
Samd9lQ69Z37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,9■■■■■ 4,62
Samd9lQ69Z37 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,61
Samd9lQ69Z37 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43,86■■■■■ 4,61
Samd9lQ69Z37 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC43,81■■■■■ 4,6
Samd9lQ69Z37 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC43,8■■■■■ 4,6
Samd9lQ69Z37 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,76■■■■■ 4,6
Samd9lQ69Z37 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Samd9lQ69Z37 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43,72■■■■■ 4,59
Samd9lQ69Z37 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43,72■■■■■ 4,59
Samd9lQ69Z37 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,7■■■■■ 4,59
Samd9lQ69Z37 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC43,7■■■■■ 4,59
Samd9lQ69Z37 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC43,7■■■■■ 4,59
Samd9lQ69Z37 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC43,65■■■■■ 4,58
Samd9lQ69Z37 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC43,65■■■■■ 4,58
Samd9lQ69Z37 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,61■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,61■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43,59■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,59■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,58■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,58■■■■■ 4,57
Samd9lQ69Z37 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
Samd9lQ69Z37 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,52■■■■■ 4,56
Samd9lQ69Z37 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
Samd9lQ69Z37 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC43,5■■■■■ 4,55
Samd9lQ69Z37 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,49■■■■■ 4,55
Samd9lQ69Z37 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC43,46■■■■■ 4,55
Samd9lQ69Z37 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Samd9lQ69Z37 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43,45■■■■■ 4,55
Samd9lQ69Z37 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,45■■■■■ 4,55
Samd9lQ69Z37 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
Samd9lQ69Z37 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC43,41■■■■■ 4,54
Samd9lQ69Z37 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,41■■■■■ 4,54
Samd9lQ69Z37 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
Samd9lQ69Z37 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Samd9lQ69Z37 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Samd9lQ69Z37 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,35■■■■■ 4,53
Samd9lQ69Z37 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,35■■■■■ 4,53
Samd9lQ69Z37 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC43,33■■■■■ 4,53
Samd9lQ69Z37 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC43,33■■■■■ 4,53
Samd9lQ69Z37 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC43,31■■■■■ 4,52
Samd9lQ69Z37 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC43,31■■■■■ 4,52
Samd9lQ69Z37 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43,29■■■■■ 4,52
Samd9lQ69Z37 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC43,29■■■■■ 4,52
Samd9lQ69Z37 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC43,25■■■■■ 4,51
Samd9lQ69Z37 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Samd9lQ69Z37 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
Samd9lQ69Z37 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC43,17■■■■■ 4,5
Samd9lQ69Z37 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Samd9lQ69Z37 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC43,16■■■■■ 4,5
Samd9lQ69Z37 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC43,16■■■■■ 4,5
Samd9lQ69Z37 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,5
Samd9lQ69Z37 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43,13■■■■■ 4,5
Samd9lQ69Z37 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
Samd9lQ69Z37 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC43,07■■■■■ 4,49
Samd9lQ69Z37 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC43,05■■■■■ 4,48
Samd9lQ69Z37 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC43,03■■■■■ 4,48
Samd9lQ69Z37 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Samd9lQ69Z37 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42,97■■■■■ 4,47
Samd9lQ69Z37 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Samd9lQ69Z37 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,88■■■■■ 4,45
Samd9lQ69Z37 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Samd9lQ69Z37 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Samd9lQ69Z37 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42,81■■■■■ 4,44
Samd9lQ69Z37 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC42,79■■■■■ 4,44
Samd9lQ69Z37 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC42,77■■■■■ 4,44
Samd9lQ69Z37 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42,75■■■■■ 4,43
Samd9lQ69Z37 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Samd9lQ69Z37 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC42,72■■■■■ 4,43
Samd9lQ69Z37 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42,71■■■■■ 4,43
Samd9lQ69Z37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC42,68■■■■■ 4,42
Samd9lQ69Z37 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Samd9lQ69Z37 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Samd9lQ69Z37 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
Samd9lQ69Z37 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42,61■■■■■ 4,41
Samd9lQ69Z37 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Samd9lQ69Z37 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,57■■■■■ 4,41
Samd9lQ69Z37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42,57■■■■■ 4,41
Samd9lQ69Z37 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,56■■■■■ 4,4
Samd9lQ69Z37 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC42,56■■■■■ 4,4
Samd9lQ69Z37 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Samd9lQ69Z37 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,54■■■■■ 4,4
Samd9lQ69Z37 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Samd9lQ69Z37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Samd9lQ69Z37 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
Samd9lQ69Z37 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
Samd9lQ69Z37 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
Samd9lQ69Z37 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
Samd9lQ69Z37 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC42,46■■■■■ 4,39
Samd9lQ69Z37 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC42,44■■■■■ 4,38
Samd9lQ69Z37 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Samd9lQ69Z37 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms