Protein–RNA interactions for Protein: Q64707

Zrsr1, U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor 35 kDa subunit-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zrsr1Q64707 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zrsr1Q64707 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zrsr1Q64707 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zrsr1Q64707 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms