Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Zeb1Q64318 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Zeb1Q64318 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Zeb1Q64318 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Zeb1Q64318 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Zeb1Q64318 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Zeb1Q64318 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Zeb1Q64318 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Zeb1Q64318 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Zeb1Q64318 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Zeb1Q64318 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
Zeb1Q64318 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Zeb1Q64318 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Zeb1Q64318 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Zeb1Q64318 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Zeb1Q64318 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Zeb1Q64318 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Zeb1Q64318 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Zeb1Q64318 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Zeb1Q64318 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Zeb1Q64318 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Zeb1Q64318 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Zeb1Q64318 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Zeb1Q64318 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Zeb1Q64318 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Zeb1Q64318 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Zeb1Q64318 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Zeb1Q64318 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Zeb1Q64318 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Zeb1Q64318 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Zeb1Q64318 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Zeb1Q64318 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Zeb1Q64318 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Zeb1Q64318 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Zeb1Q64318 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Zeb1Q64318 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Zeb1Q64318 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Zeb1Q64318 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Zeb1Q64318 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Zeb1Q64318 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Zeb1Q64318 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Zeb1Q64318 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
Zeb1Q64318 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Zeb1Q64318 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Zeb1Q64318 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Zeb1Q64318 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Zeb1Q64318 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Zeb1Q64318 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Zeb1Q64318 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Zeb1Q64318 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Zeb1Q64318 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Zeb1Q64318 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Zeb1Q64318 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Zeb1Q64318 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Zeb1Q64318 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Zeb1Q64318 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Zeb1Q64318 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Zeb1Q64318 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Zeb1Q64318 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Zeb1Q64318 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Zeb1Q64318 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Zeb1Q64318 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Zeb1Q64318 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Zeb1Q64318 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Zeb1Q64318 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Zeb1Q64318 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Zeb1Q64318 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Zeb1Q64318 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Zeb1Q64318 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
Zeb1Q64318 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Zeb1Q64318 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Zeb1Q64318 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Zeb1Q64318 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Zeb1Q64318 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Zeb1Q64318 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Zeb1Q64318 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Zeb1Q64318 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Zeb1Q64318 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Zeb1Q64318 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Zeb1Q64318 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Zeb1Q64318 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Zeb1Q64318 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Zeb1Q64318 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Zeb1Q64318 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Zeb1Q64318 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Zeb1Q64318 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Zeb1Q64318 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Zeb1Q64318 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms