Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col4a5Q63ZW6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Col4a5Q63ZW6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Col4a5Q63ZW6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Col4a5Q63ZW6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Col4a5Q63ZW6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Col4a5Q63ZW6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Col4a5Q63ZW6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col4a5Q63ZW6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Col4a5Q63ZW6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Col4a5Q63ZW6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col4a5Q63ZW6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Col4a5Q63ZW6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Col4a5Q63ZW6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Col4a5Q63ZW6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Col4a5Q63ZW6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col4a5Q63ZW6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Col4a5Q63ZW6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Col4a5Q63ZW6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Col4a5Q63ZW6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Col4a5Q63ZW6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col4a5Q63ZW6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col4a5Q63ZW6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Col4a5Q63ZW6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Col4a5Q63ZW6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Col4a5Q63ZW6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Col4a5Q63ZW6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Col4a5Q63ZW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Col4a5Q63ZW6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col4a5Q63ZW6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col4a5Q63ZW6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Col4a5Q63ZW6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col4a5Q63ZW6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col4a5Q63ZW6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col4a5Q63ZW6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Col4a5Q63ZW6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Col4a5Q63ZW6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Col4a5Q63ZW6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Col4a5Q63ZW6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Col4a5Q63ZW6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Col4a5Q63ZW6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Col4a5Q63ZW6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Col4a5Q63ZW6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Col4a5Q63ZW6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Col4a5Q63ZW6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Col4a5Q63ZW6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Col4a5Q63ZW6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col4a5Q63ZW6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Col4a5Q63ZW6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Col4a5Q63ZW6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col4a5Q63ZW6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Col4a5Q63ZW6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col4a5Q63ZW6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col4a5Q63ZW6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col4a5Q63ZW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Col4a5Q63ZW6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Col4a5Q63ZW6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Col4a5Q63ZW6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Col4a5Q63ZW6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Col4a5Q63ZW6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Col4a5Q63ZW6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Col4a5Q63ZW6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Col4a5Q63ZW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Col4a5Q63ZW6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col4a5Q63ZW6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col4a5Q63ZW6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms