Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Siglec1Q62230 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Siglec1Q62230 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Siglec1Q62230 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Siglec1Q62230 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Siglec1Q62230 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Siglec1Q62230 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Siglec1Q62230 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Siglec1Q62230 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Siglec1Q62230 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Siglec1Q62230 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Siglec1Q62230 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Siglec1Q62230 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Siglec1Q62230 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Siglec1Q62230 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Siglec1Q62230 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Siglec1Q62230 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Siglec1Q62230 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Siglec1Q62230 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Siglec1Q62230 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Siglec1Q62230 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Siglec1Q62230 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Siglec1Q62230 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Siglec1Q62230 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Siglec1Q62230 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Siglec1Q62230 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Siglec1Q62230 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Siglec1Q62230 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Siglec1Q62230 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Siglec1Q62230 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Siglec1Q62230 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Siglec1Q62230 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Siglec1Q62230 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Siglec1Q62230 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Siglec1Q62230 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Siglec1Q62230 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Siglec1Q62230 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Siglec1Q62230 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Siglec1Q62230 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Siglec1Q62230 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Siglec1Q62230 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Siglec1Q62230 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Siglec1Q62230 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Siglec1Q62230 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Siglec1Q62230 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Siglec1Q62230 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Siglec1Q62230 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Siglec1Q62230 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Siglec1Q62230 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Siglec1Q62230 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Siglec1Q62230 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Siglec1Q62230 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Siglec1Q62230 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Siglec1Q62230 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Siglec1Q62230 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Siglec1Q62230 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Siglec1Q62230 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Siglec1Q62230 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Siglec1Q62230 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Siglec1Q62230 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Siglec1Q62230 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Siglec1Q62230 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Siglec1Q62230 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Siglec1Q62230 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Siglec1Q62230 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Siglec1Q62230 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Siglec1Q62230 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Siglec1Q62230 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Siglec1Q62230 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Siglec1Q62230 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Siglec1Q62230 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Siglec1Q62230 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Siglec1Q62230 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Siglec1Q62230 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Siglec1Q62230 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Siglec1Q62230 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Siglec1Q62230 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Siglec1Q62230 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms