Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Rasa3Q60790 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Rasa3Q60790 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,22■■■□□ 2,59
Rasa3Q60790 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Rasa3Q60790 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Rasa3Q60790 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Rasa3Q60790 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Rasa3Q60790 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Rasa3Q60790 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Rasa3Q60790 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Rasa3Q60790 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Rasa3Q60790 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Rasa3Q60790 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Rasa3Q60790 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Rasa3Q60790 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Rasa3Q60790 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Rasa3Q60790 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Rasa3Q60790 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Rasa3Q60790 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
Rasa3Q60790 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Rasa3Q60790 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Rasa3Q60790 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Rasa3Q60790 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Rasa3Q60790 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Rasa3Q60790 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Rasa3Q60790 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Rasa3Q60790 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Rasa3Q60790 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Rasa3Q60790 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Rasa3Q60790 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Rasa3Q60790 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Rasa3Q60790 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Rasa3Q60790 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Rasa3Q60790 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Rasa3Q60790 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Rasa3Q60790 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Rasa3Q60790 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Rasa3Q60790 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Rasa3Q60790 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Rasa3Q60790 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Rasa3Q60790 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Rasa3Q60790 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Rasa3Q60790 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Rasa3Q60790 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Rasa3Q60790 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Rasa3Q60790 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Rasa3Q60790 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Rasa3Q60790 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Rasa3Q60790 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Rasa3Q60790 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Rasa3Q60790 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Rasa3Q60790 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Rasa3Q60790 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rasa3Q60790 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Rasa3Q60790 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Rasa3Q60790 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Rasa3Q60790 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,2 ms