Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PmelQ60696 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PmelQ60696 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PmelQ60696 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PmelQ60696 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PmelQ60696 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PmelQ60696 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PmelQ60696 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PmelQ60696 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PmelQ60696 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PmelQ60696 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PmelQ60696 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PmelQ60696 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PmelQ60696 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PmelQ60696 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PmelQ60696 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PmelQ60696 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PmelQ60696 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PmelQ60696 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PmelQ60696 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PmelQ60696 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PmelQ60696 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmelQ60696 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PmelQ60696 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmelQ60696 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PmelQ60696 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PmelQ60696 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PmelQ60696 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PmelQ60696 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PmelQ60696 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PmelQ60696 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PmelQ60696 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PmelQ60696 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PmelQ60696 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PmelQ60696 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PmelQ60696 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PmelQ60696 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PmelQ60696 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PmelQ60696 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PmelQ60696 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PmelQ60696 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PmelQ60696 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PmelQ60696 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PmelQ60696 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PmelQ60696 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PmelQ60696 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PmelQ60696 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PmelQ60696 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmelQ60696 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PmelQ60696 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PmelQ60696 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PmelQ60696 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PmelQ60696 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PmelQ60696 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PmelQ60696 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PmelQ60696 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PmelQ60696 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms