Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec4a4Q5YIR8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec4a4Q5YIR8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec4a4Q5YIR8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec4a4Q5YIR8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec4a4Q5YIR8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec4a4Q5YIR8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec4a4Q5YIR8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec4a4Q5YIR8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec4a4Q5YIR8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec4a4Q5YIR8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec4a4Q5YIR8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec4a4Q5YIR8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec4a4Q5YIR8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec4a4Q5YIR8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec4a4Q5YIR8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec4a4Q5YIR8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec4a4Q5YIR8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec4a4Q5YIR8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec4a4Q5YIR8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clec4a4Q5YIR8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec4a4Q5YIR8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec4a4Q5YIR8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec4a4Q5YIR8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4a4Q5YIR8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4a4Q5YIR8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec4a4Q5YIR8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec4a4Q5YIR8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec4a4Q5YIR8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec4a4Q5YIR8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec4a4Q5YIR8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clec4a4Q5YIR8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec4a4Q5YIR8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec4a4Q5YIR8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec4a4Q5YIR8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec4a4Q5YIR8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec4a4Q5YIR8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4a4Q5YIR8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4a4Q5YIR8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4a4Q5YIR8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clec4a4Q5YIR8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clec4a4Q5YIR8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clec4a4Q5YIR8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clec4a4Q5YIR8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4a4Q5YIR8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4a4Q5YIR8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4a4Q5YIR8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clec4a4Q5YIR8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clec4a4Q5YIR8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Clec4a4Q5YIR8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms