Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH67

Xkr4, XK-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr4Q5GH67 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xkr4Q5GH67 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xkr4Q5GH67 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xkr4Q5GH67 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Xkr4Q5GH67 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Xkr4Q5GH67 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Xkr4Q5GH67 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Xkr4Q5GH67 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Xkr4Q5GH67 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Xkr4Q5GH67 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xkr4Q5GH67 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xkr4Q5GH67 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Xkr4Q5GH67 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xkr4Q5GH67 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Xkr4Q5GH67 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xkr4Q5GH67 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Xkr4Q5GH67 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xkr4Q5GH67 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xkr4Q5GH67 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Xkr4Q5GH67 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xkr4Q5GH67 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xkr4Q5GH67 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xkr4Q5GH67 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xkr4Q5GH67 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xkr4Q5GH67 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xkr4Q5GH67 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xkr4Q5GH67 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xkr4Q5GH67 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xkr4Q5GH67 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xkr4Q5GH67 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xkr4Q5GH67 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Xkr4Q5GH67 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xkr4Q5GH67 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Xkr4Q5GH67 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Xkr4Q5GH67 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Xkr4Q5GH67 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Xkr4Q5GH67 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Xkr4Q5GH67 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xkr4Q5GH67 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xkr4Q5GH67 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xkr4Q5GH67 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Xkr4Q5GH67 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Xkr4Q5GH67 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xkr4Q5GH67 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xkr4Q5GH67 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xkr4Q5GH67 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xkr4Q5GH67 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Xkr4Q5GH67 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xkr4Q5GH67 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Xkr4Q5GH67 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xkr4Q5GH67 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xkr4Q5GH67 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xkr4Q5GH67 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Xkr4Q5GH67 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xkr4Q5GH67 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xkr4Q5GH67 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xkr4Q5GH67 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms