Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH67

Xkr4, XK-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr4Q5GH67 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Xkr4Q5GH67 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Xkr4Q5GH67 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Xkr4Q5GH67 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Xkr4Q5GH67 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Xkr4Q5GH67 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Xkr4Q5GH67 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Xkr4Q5GH67 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Xkr4Q5GH67 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Xkr4Q5GH67 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Xkr4Q5GH67 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Xkr4Q5GH67 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Xkr4Q5GH67 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Xkr4Q5GH67 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Xkr4Q5GH67 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Xkr4Q5GH67 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Xkr4Q5GH67 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Xkr4Q5GH67 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Xkr4Q5GH67 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Xkr4Q5GH67 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Xkr4Q5GH67 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Xkr4Q5GH67 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Xkr4Q5GH67 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Xkr4Q5GH67 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Xkr4Q5GH67 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Xkr4Q5GH67 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Xkr4Q5GH67 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Xkr4Q5GH67 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Xkr4Q5GH67 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Xkr4Q5GH67 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Xkr4Q5GH67 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Xkr4Q5GH67 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Xkr4Q5GH67 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Xkr4Q5GH67 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Xkr4Q5GH67 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Xkr4Q5GH67 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Xkr4Q5GH67 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Xkr4Q5GH67 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Xkr4Q5GH67 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Xkr4Q5GH67 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Xkr4Q5GH67 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,26■■■□□ 2,12
Xkr4Q5GH67 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Xkr4Q5GH67 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Xkr4Q5GH67 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Xkr4Q5GH67 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Xkr4Q5GH67 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Xkr4Q5GH67 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Xkr4Q5GH67 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Xkr4Q5GH67 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Xkr4Q5GH67 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Xkr4Q5GH67 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Xkr4Q5GH67 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Xkr4Q5GH67 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Xkr4Q5GH67 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Xkr4Q5GH67 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Xkr4Q5GH67 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Xkr4Q5GH67 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms