Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc84Q4VA36 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc84Q4VA36 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc84Q4VA36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc84Q4VA36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc84Q4VA36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc84Q4VA36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc84Q4VA36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc84Q4VA36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc84Q4VA36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc84Q4VA36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccdc84Q4VA36 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc84Q4VA36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc84Q4VA36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc84Q4VA36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc84Q4VA36 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc84Q4VA36 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc84Q4VA36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc84Q4VA36 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc84Q4VA36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc84Q4VA36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc84Q4VA36 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc84Q4VA36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc84Q4VA36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc84Q4VA36 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc84Q4VA36 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc84Q4VA36 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc84Q4VA36 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc84Q4VA36 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc84Q4VA36 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc84Q4VA36 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc84Q4VA36 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc84Q4VA36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc84Q4VA36 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc84Q4VA36 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc84Q4VA36 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc84Q4VA36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc84Q4VA36 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc84Q4VA36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc84Q4VA36 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc84Q4VA36 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc84Q4VA36 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc84Q4VA36 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc84Q4VA36 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc84Q4VA36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc84Q4VA36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc84Q4VA36 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc84Q4VA36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc84Q4VA36 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc84Q4VA36 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc84Q4VA36 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc84Q4VA36 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc84Q4VA36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc84Q4VA36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc84Q4VA36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc84Q4VA36 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc84Q4VA36 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc84Q4VA36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc84Q4VA36 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms