Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rnpc3Q3UZ01 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnpc3Q3UZ01 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rnpc3Q3UZ01 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rnpc3Q3UZ01 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnpc3Q3UZ01 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnpc3Q3UZ01 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnpc3Q3UZ01 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rnpc3Q3UZ01 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnpc3Q3UZ01 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnpc3Q3UZ01 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnpc3Q3UZ01 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rnpc3Q3UZ01 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rnpc3Q3UZ01 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnpc3Q3UZ01 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnpc3Q3UZ01 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnpc3Q3UZ01 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rnpc3Q3UZ01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnpc3Q3UZ01 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnpc3Q3UZ01 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnpc3Q3UZ01 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnpc3Q3UZ01 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rnpc3Q3UZ01 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnpc3Q3UZ01 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnpc3Q3UZ01 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnpc3Q3UZ01 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnpc3Q3UZ01 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnpc3Q3UZ01 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnpc3Q3UZ01 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnpc3Q3UZ01 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnpc3Q3UZ01 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnpc3Q3UZ01 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rnpc3Q3UZ01 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnpc3Q3UZ01 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnpc3Q3UZ01 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnpc3Q3UZ01 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnpc3Q3UZ01 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnpc3Q3UZ01 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnpc3Q3UZ01 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnpc3Q3UZ01 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnpc3Q3UZ01 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms