Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc33Q3ULW6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc33Q3ULW6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc33Q3ULW6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc33Q3ULW6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc33Q3ULW6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc33Q3ULW6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc33Q3ULW6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc33Q3ULW6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc33Q3ULW6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc33Q3ULW6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc33Q3ULW6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc33Q3ULW6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc33Q3ULW6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc33Q3ULW6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc33Q3ULW6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc33Q3ULW6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc33Q3ULW6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc33Q3ULW6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc33Q3ULW6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc33Q3ULW6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc33Q3ULW6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc33Q3ULW6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc33Q3ULW6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc33Q3ULW6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc33Q3ULW6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc33Q3ULW6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc33Q3ULW6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc33Q3ULW6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc33Q3ULW6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc33Q3ULW6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc33Q3ULW6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc33Q3ULW6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc33Q3ULW6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc33Q3ULW6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc33Q3ULW6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc33Q3ULW6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc33Q3ULW6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc33Q3ULW6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc33Q3ULW6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc33Q3ULW6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc33Q3ULW6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc33Q3ULW6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc33Q3ULW6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc33Q3ULW6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc33Q3ULW6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc33Q3ULW6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc33Q3ULW6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc33Q3ULW6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc33Q3ULW6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc33Q3ULW6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc33Q3ULW6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc33Q3ULW6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc33Q3ULW6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc33Q3ULW6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc33Q3ULW6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc33Q3ULW6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc33Q3ULW6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc33Q3ULW6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms