Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ctsll3Q3ULP7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ctsll3Q3ULP7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Ctsll3Q3ULP7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ctsll3Q3ULP7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ctsll3Q3ULP7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ctsll3Q3ULP7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ctsll3Q3ULP7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Ctsll3Q3ULP7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ctsll3Q3ULP7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,64■■□□□ 1,54
Ctsll3Q3ULP7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Ctsll3Q3ULP7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ctsll3Q3ULP7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ctsll3Q3ULP7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ctsll3Q3ULP7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ctsll3Q3ULP7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ctsll3Q3ULP7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ctsll3Q3ULP7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ctsll3Q3ULP7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ctsll3Q3ULP7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ctsll3Q3ULP7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ctsll3Q3ULP7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ctsll3Q3ULP7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Ctsll3Q3ULP7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ctsll3Q3ULP7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ctsll3Q3ULP7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ctsll3Q3ULP7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ctsll3Q3ULP7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ctsll3Q3ULP7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ctsll3Q3ULP7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Ctsll3Q3ULP7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ctsll3Q3ULP7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ctsll3Q3ULP7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Ctsll3Q3ULP7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Ctsll3Q3ULP7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ctsll3Q3ULP7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ctsll3Q3ULP7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ctsll3Q3ULP7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ctsll3Q3ULP7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ctsll3Q3ULP7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ctsll3Q3ULP7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Ctsll3Q3ULP7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ctsll3Q3ULP7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ctsll3Q3ULP7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ctsll3Q3ULP7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ctsll3Q3ULP7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ctsll3Q3ULP7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ctsll3Q3ULP7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ctsll3Q3ULP7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ctsll3Q3ULP7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ctsll3Q3ULP7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ctsll3Q3ULP7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
Ctsll3Q3ULP7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ctsll3Q3ULP7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ctsll3Q3ULP7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ctsll3Q3ULP7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ctsll3Q3ULP7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ctsll3Q3ULP7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ctsll3Q3ULP7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ctsll3Q3ULP7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Ctsll3Q3ULP7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ctsll3Q3ULP7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ctsll3Q3ULP7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,7 ms