Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp8Q3UD82 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parp8Q3UD82 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp8Q3UD82 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp8Q3UD82 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp8Q3UD82 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Parp8Q3UD82 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp8Q3UD82 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp8Q3UD82 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp8Q3UD82 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp8Q3UD82 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp8Q3UD82 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp8Q3UD82 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp8Q3UD82 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp8Q3UD82 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp8Q3UD82 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp8Q3UD82 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Parp8Q3UD82 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Parp8Q3UD82 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Parp8Q3UD82 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Parp8Q3UD82 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Parp8Q3UD82 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp8Q3UD82 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp8Q3UD82 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Parp8Q3UD82 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp8Q3UD82 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp8Q3UD82 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp8Q3UD82 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp8Q3UD82 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp8Q3UD82 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Parp8Q3UD82 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp8Q3UD82 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp8Q3UD82 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp8Q3UD82 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp8Q3UD82 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp8Q3UD82 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp8Q3UD82 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Parp8Q3UD82 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Parp8Q3UD82 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Parp8Q3UD82 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Parp8Q3UD82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Parp8Q3UD82 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms