Protein–RNA interactions for Protein: Q3UB74

Tbrg1, Transforming growth factor beta regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbrg1Q3UB74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbrg1Q3UB74 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbrg1Q3UB74 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbrg1Q3UB74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbrg1Q3UB74 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbrg1Q3UB74 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbrg1Q3UB74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbrg1Q3UB74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbrg1Q3UB74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbrg1Q3UB74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbrg1Q3UB74 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbrg1Q3UB74 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbrg1Q3UB74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbrg1Q3UB74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbrg1Q3UB74 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbrg1Q3UB74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbrg1Q3UB74 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbrg1Q3UB74 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbrg1Q3UB74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbrg1Q3UB74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbrg1Q3UB74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbrg1Q3UB74 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbrg1Q3UB74 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbrg1Q3UB74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbrg1Q3UB74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbrg1Q3UB74 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbrg1Q3UB74 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbrg1Q3UB74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbrg1Q3UB74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbrg1Q3UB74 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbrg1Q3UB74 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbrg1Q3UB74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbrg1Q3UB74 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbrg1Q3UB74 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbrg1Q3UB74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbrg1Q3UB74 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbrg1Q3UB74 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbrg1Q3UB74 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbrg1Q3UB74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbrg1Q3UB74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbrg1Q3UB74 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbrg1Q3UB74 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbrg1Q3UB74 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbrg1Q3UB74 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbrg1Q3UB74 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms