Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,35■■■■■ 5,33
Smarca4Q3TKT4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,34■■■■■ 5,33
Smarca4Q3TKT4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC48,29■■■■■ 5,32
Smarca4Q3TKT4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC48,29■■■■■ 5,32
Smarca4Q3TKT4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,29■■■■■ 5,32
Smarca4Q3TKT4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,28■■■■■ 5,32
Smarca4Q3TKT4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,24■■■■■ 5,31
Smarca4Q3TKT4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC48,19■■■■■ 5,31
Smarca4Q3TKT4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC48,18■■■■■ 5,3
Smarca4Q3TKT4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,16■■■■■ 5,3
Smarca4Q3TKT4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC48,15■■■■■ 5,3
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,12■■■■■ 5,29
Smarca4Q3TKT4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC48,05■■■■■ 5,28
Smarca4Q3TKT4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48,03■■■■■ 5,28
Smarca4Q3TKT4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,03■■■■■ 5,28
Smarca4Q3TKT4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5,27
Smarca4Q3TKT4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,98■■■■■ 5,27
Smarca4Q3TKT4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,98■■■■■ 5,27
Smarca4Q3TKT4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC47,98■■■■■ 5,27
Smarca4Q3TKT4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC47,95■■■■■ 5,27
Smarca4Q3TKT4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC47,92■■■■■ 5,26
Smarca4Q3TKT4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47,91■■■■■ 5,26
Smarca4Q3TKT4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,89■■■■■ 5,26
Smarca4Q3TKT4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,89■■■■■ 5,26
Smarca4Q3TKT4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,88■■■■■ 5,26
Smarca4Q3TKT4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC47,86■■■■■ 5,25
Smarca4Q3TKT4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC47,83■■■■■ 5,25
Smarca4Q3TKT4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC47,82■■■■■ 5,25
Smarca4Q3TKT4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC47,8■■■■■ 5,24
Smarca4Q3TKT4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47,78■■■■■ 5,24
Smarca4Q3TKT4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC47,78■■■■■ 5,24
Smarca4Q3TKT4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,78■■■■■ 5,24
Smarca4Q3TKT4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC47,77■■■■■ 5,24
Smarca4Q3TKT4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,76■■■■■ 5,24
Smarca4Q3TKT4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,75■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC47,75■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,74■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,74■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC47,72■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC47,72■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,7■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC47,7■■■■■ 5,23
Smarca4Q3TKT4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,69■■■■■ 5,22
Smarca4Q3TKT4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC47,68■■■■■ 5,22
Smarca4Q3TKT4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,63■■■■■ 5,22
Smarca4Q3TKT4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC47,62■■■■■ 5,21
Smarca4Q3TKT4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC47,6■■■■■ 5,21
Smarca4Q3TKT4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,6■■■■■ 5,21
Smarca4Q3TKT4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,6■■■■■ 5,21
Smarca4Q3TKT4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC47,6■■■■■ 5,21
Smarca4Q3TKT4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC47,57■■■■■ 5,21
Smarca4Q3TKT4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC47,56■■■■■ 5,2
Smarca4Q3TKT4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
Smarca4Q3TKT4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
Smarca4Q3TKT4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
Smarca4Q3TKT4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC47,49■■■■■ 5,19
Smarca4Q3TKT4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC47,46■■■■■ 5,19
Smarca4Q3TKT4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC47,45■■■■■ 5,19
Smarca4Q3TKT4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC47,4■■■■■ 5,18
Smarca4Q3TKT4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC47,38■■■■■ 5,18
Smarca4Q3TKT4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC47,33■■■■■ 5,17
Smarca4Q3TKT4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC47,29■■■■■ 5,16
Smarca4Q3TKT4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,29■■■■■ 5,16
Smarca4Q3TKT4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC47,28■■■■■ 5,16
Smarca4Q3TKT4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC47,22■■■■■ 5,15
Smarca4Q3TKT4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,22■■■■■ 5,15
Smarca4Q3TKT4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC47,19■■■■■ 5,14
Smarca4Q3TKT4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC47,13■■■■■ 5,14
Smarca4Q3TKT4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47,11■■■■■ 5,13
Smarca4Q3TKT4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC47,04■■■■■ 5,12
Smarca4Q3TKT4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC47,03■■■■■ 5,12
Smarca4Q3TKT4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC47,03■■■■■ 5,12
Smarca4Q3TKT4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,02■■■■■ 5,12
Smarca4Q3TKT4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,01■■■■■ 5,12
Smarca4Q3TKT4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC47,01■■■■■ 5,12
Smarca4Q3TKT4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,95■■■■■ 5,11
Smarca4Q3TKT4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,93■■■■■ 5,1
Smarca4Q3TKT4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC46,91■■■■■ 5,1
Smarca4Q3TKT4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC46,9■■■■■ 5,1
Smarca4Q3TKT4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,88■■■■■ 5,1
Smarca4Q3TKT4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC46,85■■■■■ 5,09
Smarca4Q3TKT4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC46,78■■■■■ 5,08
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,75■■■■■ 5,07
Smarca4Q3TKT4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC46,73■■■■■ 5,07
Smarca4Q3TKT4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,73■■■■■ 5,07
Smarca4Q3TKT4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,72■■■■■ 5,07
Smarca4Q3TKT4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC46,68■■■■■ 5,06
Smarca4Q3TKT4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,67■■■■■ 5,06
Smarca4Q3TKT4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC46,67■■■■■ 5,06
Smarca4Q3TKT4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC46,66■■■■■ 5,06
Smarca4Q3TKT4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,59■■■■■ 5,05
Smarca4Q3TKT4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,57■■■■■ 5,05
Smarca4Q3TKT4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,52■■■■■ 5,04
Smarca4Q3TKT4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC46,51■■■■■ 5,04
Smarca4Q3TKT4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC46,5■■■■■ 5,03
Smarca4Q3TKT4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,5■■■■■ 5,03
Smarca4Q3TKT4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,49■■■■■ 5,03
Smarca4Q3TKT4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC46,48■■■■■ 5,03
Smarca4Q3TKT4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,48■■■■■ 5,03
Smarca4Q3TKT4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC46,48■■■■■ 5,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms