Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Chrna5Q2MKA5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Chrna5Q2MKA5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Chrna5Q2MKA5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Chrna5Q2MKA5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Chrna5Q2MKA5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Chrna5Q2MKA5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Chrna5Q2MKA5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32,45■■■□□ 2,79
Chrna5Q2MKA5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Chrna5Q2MKA5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Chrna5Q2MKA5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Chrna5Q2MKA5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Chrna5Q2MKA5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Chrna5Q2MKA5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Chrna5Q2MKA5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Chrna5Q2MKA5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Chrna5Q2MKA5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Chrna5Q2MKA5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Chrna5Q2MKA5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Chrna5Q2MKA5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Chrna5Q2MKA5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Chrna5Q2MKA5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Chrna5Q2MKA5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Chrna5Q2MKA5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Chrna5Q2MKA5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Chrna5Q2MKA5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Chrna5Q2MKA5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Chrna5Q2MKA5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Chrna5Q2MKA5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Chrna5Q2MKA5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Chrna5Q2MKA5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Chrna5Q2MKA5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Chrna5Q2MKA5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Chrna5Q2MKA5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Chrna5Q2MKA5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Chrna5Q2MKA5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Chrna5Q2MKA5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Chrna5Q2MKA5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Chrna5Q2MKA5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Chrna5Q2MKA5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Chrna5Q2MKA5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Chrna5Q2MKA5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Chrna5Q2MKA5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Chrna5Q2MKA5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Chrna5Q2MKA5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Chrna5Q2MKA5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Chrna5Q2MKA5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Chrna5Q2MKA5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Chrna5Q2MKA5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Chrna5Q2MKA5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Chrna5Q2MKA5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Chrna5Q2MKA5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Chrna5Q2MKA5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Chrna5Q2MKA5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Chrna5Q2MKA5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Chrna5Q2MKA5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Chrna5Q2MKA5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Chrna5Q2MKA5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Chrna5Q2MKA5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Chrna5Q2MKA5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Chrna5Q2MKA5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Chrna5Q2MKA5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Chrna5Q2MKA5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Chrna5Q2MKA5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Chrna5Q2MKA5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Chrna5Q2MKA5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Chrna5Q2MKA5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Chrna5Q2MKA5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Chrna5Q2MKA5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Chrna5Q2MKA5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Chrna5Q2MKA5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Chrna5Q2MKA5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Chrna5Q2MKA5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Chrna5Q2MKA5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Chrna5Q2MKA5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Chrna5Q2MKA5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Chrna5Q2MKA5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,4 ms