Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Shroom4Q1W617 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Shroom4Q1W617 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Shroom4Q1W617 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Shroom4Q1W617 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Shroom4Q1W617 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Shroom4Q1W617 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Shroom4Q1W617 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Shroom4Q1W617 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Shroom4Q1W617 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Shroom4Q1W617 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Shroom4Q1W617 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Shroom4Q1W617 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Shroom4Q1W617 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Shroom4Q1W617 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Shroom4Q1W617 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
Shroom4Q1W617 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Shroom4Q1W617 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Shroom4Q1W617 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Shroom4Q1W617 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Shroom4Q1W617 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Shroom4Q1W617 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Shroom4Q1W617 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Shroom4Q1W617 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Shroom4Q1W617 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
Shroom4Q1W617 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Shroom4Q1W617 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Shroom4Q1W617 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Shroom4Q1W617 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Shroom4Q1W617 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Shroom4Q1W617 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Shroom4Q1W617 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
Shroom4Q1W617 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Shroom4Q1W617 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Shroom4Q1W617 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Shroom4Q1W617 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Shroom4Q1W617 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Shroom4Q1W617 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Shroom4Q1W617 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Shroom4Q1W617 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
Shroom4Q1W617 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Shroom4Q1W617 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Shroom4Q1W617 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Shroom4Q1W617 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Shroom4Q1W617 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Shroom4Q1W617 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Shroom4Q1W617 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Shroom4Q1W617 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Shroom4Q1W617 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Shroom4Q1W617 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Shroom4Q1W617 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Shroom4Q1W617 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Shroom4Q1W617 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Shroom4Q1W617 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Shroom4Q1W617 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Shroom4Q1W617 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Shroom4Q1W617 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.43
Shroom4Q1W617 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Shroom4Q1W617 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Shroom4Q1W617 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Shroom4Q1W617 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Shroom4Q1W617 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Shroom4Q1W617 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Shroom4Q1W617 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Shroom4Q1W617 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
Shroom4Q1W617 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Shroom4Q1W617 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Shroom4Q1W617 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Shroom4Q1W617 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Shroom4Q1W617 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Shroom4Q1W617 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Shroom4Q1W617 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Shroom4Q1W617 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Shroom4Q1W617 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Shroom4Q1W617 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Shroom4Q1W617 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
Shroom4Q1W617 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Shroom4Q1W617 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Shroom4Q1W617 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Shroom4Q1W617 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Shroom4Q1W617 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Shroom4Q1W617 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
Shroom4Q1W617 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Shroom4Q1W617 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Shroom4Q1W617 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Shroom4Q1W617 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Shroom4Q1W617 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Shroom4Q1W617 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Shroom4Q1W617 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
Shroom4Q1W617 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Shroom4Q1W617 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Shroom4Q1W617 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Shroom4Q1W617 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Shroom4Q1W617 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Shroom4Q1W617 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Shroom4Q1W617 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Shroom4Q1W617 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Shroom4Q1W617 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Shroom4Q1W617 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Shroom4Q1W617 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms