Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd12Q0VE29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd12Q0VE29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd12Q0VE29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd12Q0VE29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms