Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Lrriq1Q0P5X1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Lrriq1Q0P5X1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Lrriq1Q0P5X1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Lrriq1Q0P5X1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Lrriq1Q0P5X1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Lrriq1Q0P5X1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
Lrriq1Q0P5X1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
Lrriq1Q0P5X1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Lrriq1Q0P5X1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Lrriq1Q0P5X1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Lrriq1Q0P5X1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Lrriq1Q0P5X1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
Lrriq1Q0P5X1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Lrriq1Q0P5X1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
Lrriq1Q0P5X1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Lrriq1Q0P5X1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Lrriq1Q0P5X1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
Lrriq1Q0P5X1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Lrriq1Q0P5X1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Lrriq1Q0P5X1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Lrriq1Q0P5X1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Lrriq1Q0P5X1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Lrriq1Q0P5X1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Lrriq1Q0P5X1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Lrriq1Q0P5X1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Lrriq1Q0P5X1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Lrriq1Q0P5X1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Lrriq1Q0P5X1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Lrriq1Q0P5X1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Lrriq1Q0P5X1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Lrriq1Q0P5X1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
Lrriq1Q0P5X1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Lrriq1Q0P5X1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Lrriq1Q0P5X1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Lrriq1Q0P5X1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Lrriq1Q0P5X1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
Lrriq1Q0P5X1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
Lrriq1Q0P5X1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
Lrriq1Q0P5X1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
Lrriq1Q0P5X1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Lrriq1Q0P5X1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Lrriq1Q0P5X1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Lrriq1Q0P5X1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Lrriq1Q0P5X1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Lrriq1Q0P5X1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Lrriq1Q0P5X1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Lrriq1Q0P5X1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
Lrriq1Q0P5X1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Lrriq1Q0P5X1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Lrriq1Q0P5X1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
Lrriq1Q0P5X1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
Lrriq1Q0P5X1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Lrriq1Q0P5X1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Lrriq1Q0P5X1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
Lrriq1Q0P5X1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Lrriq1Q0P5X1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Lrriq1Q0P5X1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Lrriq1Q0P5X1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Lrriq1Q0P5X1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Lrriq1Q0P5X1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
Lrriq1Q0P5X1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Lrriq1Q0P5X1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Lrriq1Q0P5X1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Lrriq1Q0P5X1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Lrriq1Q0P5X1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Lrriq1Q0P5X1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Lrriq1Q0P5X1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Lrriq1Q0P5X1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Lrriq1Q0P5X1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Lrriq1Q0P5X1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Lrriq1Q0P5X1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Lrriq1Q0P5X1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Lrriq1Q0P5X1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Lrriq1Q0P5X1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Lrriq1Q0P5X1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lrriq1Q0P5X1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Lrriq1Q0P5X1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Lrriq1Q0P5X1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Lrriq1Q0P5X1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Lrriq1Q0P5X1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Lrriq1Q0P5X1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Lrriq1Q0P5X1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Lrriq1Q0P5X1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Lrriq1Q0P5X1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Lrriq1Q0P5X1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms