Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ebf1Q07802 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ebf1Q07802 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ebf1Q07802 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ebf1Q07802 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ebf1Q07802 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ebf1Q07802 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ebf1Q07802 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ebf1Q07802 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ebf1Q07802 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ebf1Q07802 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ebf1Q07802 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ebf1Q07802 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ebf1Q07802 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ebf1Q07802 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ebf1Q07802 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ebf1Q07802 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ebf1Q07802 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ebf1Q07802 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ebf1Q07802 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ebf1Q07802 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ebf1Q07802 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ebf1Q07802 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ebf1Q07802 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ebf1Q07802 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ebf1Q07802 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ebf1Q07802 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ebf1Q07802 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ebf1Q07802 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ebf1Q07802 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ebf1Q07802 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ebf1Q07802 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ebf1Q07802 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ebf1Q07802 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ebf1Q07802 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ebf1Q07802 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ebf1Q07802 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ebf1Q07802 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ebf1Q07802 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ebf1Q07802 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ebf1Q07802 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ebf1Q07802 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ebf1Q07802 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ebf1Q07802 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ebf1Q07802 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ebf1Q07802 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ebf1Q07802 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ebf1Q07802 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ebf1Q07802 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ebf1Q07802 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ebf1Q07802 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ebf1Q07802 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ebf1Q07802 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ebf1Q07802 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ebf1Q07802 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ebf1Q07802 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ebf1Q07802 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms