Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmbpQ07456 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmbpQ07456 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmbpQ07456 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmbpQ07456 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmbpQ07456 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmbpQ07456 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmbpQ07456 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AmbpQ07456 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmbpQ07456 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AmbpQ07456 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmbpQ07456 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmbpQ07456 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmbpQ07456 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmbpQ07456 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmbpQ07456 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmbpQ07456 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbpQ07456 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbpQ07456 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmbpQ07456 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmbpQ07456 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmbpQ07456 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmbpQ07456 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AmbpQ07456 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmbpQ07456 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AmbpQ07456 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmbpQ07456 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmbpQ07456 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AmbpQ07456 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmbpQ07456 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmbpQ07456 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmbpQ07456 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmbpQ07456 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmbpQ07456 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms