Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Gdf9Q07105 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Gdf9Q07105 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Gdf9Q07105 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gdf9Q07105 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gdf9Q07105 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gdf9Q07105 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Gdf9Q07105 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gdf9Q07105 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gdf9Q07105 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gdf9Q07105 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gdf9Q07105 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Gdf9Q07105 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Gdf9Q07105 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Gdf9Q07105 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gdf9Q07105 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gdf9Q07105 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gdf9Q07105 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gdf9Q07105 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gdf9Q07105 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gdf9Q07105 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Gdf9Q07105 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Gdf9Q07105 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gdf9Q07105 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gdf9Q07105 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gdf9Q07105 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gdf9Q07105 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gdf9Q07105 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gdf9Q07105 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gdf9Q07105 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gdf9Q07105 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gdf9Q07105 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gdf9Q07105 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gdf9Q07105 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gdf9Q07105 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gdf9Q07105 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gdf9Q07105 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gdf9Q07105 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gdf9Q07105 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gdf9Q07105 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gdf9Q07105 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gdf9Q07105 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gdf9Q07105 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gdf9Q07105 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gdf9Q07105 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gdf9Q07105 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gdf9Q07105 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gdf9Q07105 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gdf9Q07105 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gdf9Q07105 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Gdf9Q07105 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gdf9Q07105 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gdf9Q07105 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms