Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gdf9Q07105 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gdf9Q07105 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gdf9Q07105 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gdf9Q07105 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gdf9Q07105 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gdf9Q07105 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gdf9Q07105 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gdf9Q07105 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gdf9Q07105 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gdf9Q07105 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gdf9Q07105 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gdf9Q07105 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gdf9Q07105 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gdf9Q07105 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gdf9Q07105 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gdf9Q07105 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gdf9Q07105 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gdf9Q07105 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gdf9Q07105 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gdf9Q07105 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gdf9Q07105 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gdf9Q07105 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gdf9Q07105 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gdf9Q07105 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gdf9Q07105 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gdf9Q07105 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gdf9Q07105 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gdf9Q07105 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gdf9Q07105 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gdf9Q07105 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gdf9Q07105 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gdf9Q07105 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gdf9Q07105 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gdf9Q07105 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gdf9Q07105 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf9Q07105 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf9Q07105 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf9Q07105 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf9Q07105 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf9Q07105 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf9Q07105 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gdf9Q07105 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gdf9Q07105 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gdf9Q07105 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gdf9Q07105 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdf9Q07105 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdf9Q07105 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gdf9Q07105 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdf9Q07105 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gdf9Q07105 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gdf9Q07105 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gdf9Q07105 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms