Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brca2P97929 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brca2P97929 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Brca2P97929 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brca2P97929 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca2P97929 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca2P97929 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brca2P97929 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca2P97929 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca2P97929 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brca2P97929 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brca2P97929 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brca2P97929 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca2P97929 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca2P97929 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brca2P97929 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brca2P97929 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brca2P97929 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Brca2P97929 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brca2P97929 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Brca2P97929 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brca2P97929 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brca2P97929 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brca2P97929 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brca2P97929 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brca2P97929 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brca2P97929 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brca2P97929 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brca2P97929 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brca2P97929 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Brca2P97929 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca2P97929 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca2P97929 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca2P97929 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca2P97929 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brca2P97929 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brca2P97929 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brca2P97929 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brca2P97929 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brca2P97929 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brca2P97929 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brca2P97929 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brca2P97929 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brca2P97929 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brca2P97929 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Brca2P97929 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brca2P97929 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brca2P97929 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brca2P97929 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brca2P97929 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brca2P97929 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Brca2P97929 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Brca2P97929 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brca2P97929 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Brca2P97929 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brca2P97929 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brca2P97929 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca2P97929 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brca2P97929 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brca2P97929 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brca2P97929 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brca2P97929 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Brca2P97929 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brca2P97929 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brca2P97929 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brca2P97929 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brca2P97929 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca2P97929 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca2P97929 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca2P97929 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Brca2P97929 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Brca2P97929 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brca2P97929 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brca2P97929 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brca2P97929 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brca2P97929 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brca2P97929 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brca2P97929 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brca2P97929 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca2P97929 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brca2P97929 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brca2P97929 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brca2P97929 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brca2P97929 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms