Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vgll3P85442 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vgll3P85442 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vgll3P85442 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vgll3P85442 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Vgll3P85442 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vgll3P85442 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vgll3P85442 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vgll3P85442 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vgll3P85442 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vgll3P85442 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vgll3P85442 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vgll3P85442 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vgll3P85442 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vgll3P85442 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vgll3P85442 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vgll3P85442 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vgll3P85442 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vgll3P85442 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vgll3P85442 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vgll3P85442 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vgll3P85442 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vgll3P85442 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vgll3P85442 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vgll3P85442 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vgll3P85442 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vgll3P85442 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vgll3P85442 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vgll3P85442 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vgll3P85442 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vgll3P85442 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vgll3P85442 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vgll3P85442 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vgll3P85442 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vgll3P85442 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vgll3P85442 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vgll3P85442 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vgll3P85442 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vgll3P85442 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vgll3P85442 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vgll3P85442 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vgll3P85442 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vgll3P85442 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vgll3P85442 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vgll3P85442 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms