Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tp53bp1P70399 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tp53bp1P70399 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tp53bp1P70399 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tp53bp1P70399 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tp53bp1P70399 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tp53bp1P70399 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tp53bp1P70399 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tp53bp1P70399 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tp53bp1P70399 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tp53bp1P70399 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tp53bp1P70399 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tp53bp1P70399 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tp53bp1P70399 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tp53bp1P70399 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tp53bp1P70399 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tp53bp1P70399 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tp53bp1P70399 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tp53bp1P70399 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tp53bp1P70399 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tp53bp1P70399 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tp53bp1P70399 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tp53bp1P70399 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tp53bp1P70399 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tp53bp1P70399 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tp53bp1P70399 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tp53bp1P70399 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tp53bp1P70399 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tp53bp1P70399 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tp53bp1P70399 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tp53bp1P70399 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tp53bp1P70399 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tp53bp1P70399 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tp53bp1P70399 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tp53bp1P70399 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tp53bp1P70399 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tp53bp1P70399 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tp53bp1P70399 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tp53bp1P70399 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tp53bp1P70399 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tp53bp1P70399 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tp53bp1P70399 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tp53bp1P70399 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tp53bp1P70399 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tp53bp1P70399 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tp53bp1P70399 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tp53bp1P70399 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tp53bp1P70399 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tp53bp1P70399 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tp53bp1P70399 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tp53bp1P70399 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tp53bp1P70399 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tp53bp1P70399 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tp53bp1P70399 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tp53bp1P70399 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tp53bp1P70399 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tp53bp1P70399 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tp53bp1P70399 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tp53bp1P70399 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tp53bp1P70399 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tp53bp1P70399 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tp53bp1P70399 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tp53bp1P70399 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms