Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Ncoa1P70365 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ncoa1P70365 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ncoa1P70365 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ncoa1P70365 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ncoa1P70365 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ncoa1P70365 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ncoa1P70365 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ncoa1P70365 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ncoa1P70365 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ncoa1P70365 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ncoa1P70365 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ncoa1P70365 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ncoa1P70365 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ncoa1P70365 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Ncoa1P70365 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ncoa1P70365 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
Ncoa1P70365 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ncoa1P70365 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ncoa1P70365 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Ncoa1P70365 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ncoa1P70365 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ncoa1P70365 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ncoa1P70365 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ncoa1P70365 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ncoa1P70365 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ncoa1P70365 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ncoa1P70365 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ncoa1P70365 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ncoa1P70365 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ncoa1P70365 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ncoa1P70365 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ncoa1P70365 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ncoa1P70365 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ncoa1P70365 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ncoa1P70365 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ncoa1P70365 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ncoa1P70365 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ncoa1P70365 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ncoa1P70365 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ncoa1P70365 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ncoa1P70365 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ncoa1P70365 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ncoa1P70365 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ncoa1P70365 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ncoa1P70365 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ncoa1P70365 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ncoa1P70365 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ncoa1P70365 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ncoa1P70365 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ncoa1P70365 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ncoa1P70365 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ncoa1P70365 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Ncoa1P70365 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ncoa1P70365 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ncoa1P70365 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ncoa1P70365 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Ncoa1P70365 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ncoa1P70365 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ncoa1P70365 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ncoa1P70365 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Ncoa1P70365 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ncoa1P70365 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ncoa1P70365 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Ncoa1P70365 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ncoa1P70365 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Ncoa1P70365 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Ncoa1P70365 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ncoa1P70365 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ncoa1P70365 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ncoa1P70365 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ncoa1P70365 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ncoa1P70365 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ncoa1P70365 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ncoa1P70365 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ncoa1P70365 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ncoa1P70365 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ncoa1P70365 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ncoa1P70365 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Ncoa1P70365 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Ncoa1P70365 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ncoa1P70365 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ncoa1P70365 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ncoa1P70365 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ncoa1P70365 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ncoa1P70365 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms