Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Surf6P70279 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Surf6P70279 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Surf6P70279 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Surf6P70279 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Surf6P70279 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Surf6P70279 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Surf6P70279 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Surf6P70279 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Surf6P70279 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Surf6P70279 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Surf6P70279 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Surf6P70279 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Surf6P70279 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Surf6P70279 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Surf6P70279 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Surf6P70279 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Surf6P70279 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Surf6P70279 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Surf6P70279 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Surf6P70279 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf6P70279 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Surf6P70279 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Surf6P70279 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Surf6P70279 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Surf6P70279 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Surf6P70279 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Surf6P70279 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Surf6P70279 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Surf6P70279 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Surf6P70279 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Surf6P70279 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Surf6P70279 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Surf6P70279 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Surf6P70279 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Surf6P70279 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Surf6P70279 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Surf6P70279 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Surf6P70279 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Surf6P70279 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Surf6P70279 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Surf6P70279 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Surf6P70279 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Surf6P70279 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Surf6P70279 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Surf6P70279 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Surf6P70279 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf6P70279 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Surf6P70279 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Surf6P70279 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Surf6P70279 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Surf6P70279 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Surf6P70279 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Surf6P70279 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Surf6P70279 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms