Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.21■■■■■ 6.59
Abcc9P70170 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC56.18■■■■■ 6.58
Abcc9P70170 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.17■■■■■ 6.58
Abcc9P70170 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.13■■■■■ 6.58
Abcc9P70170 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC56.13■■■■■ 6.58
Abcc9P70170 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC56.12■■■■■ 6.57
Abcc9P70170 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC56.04■■■■■ 6.56
Abcc9P70170 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.01■■■■■ 6.56
Abcc9P70170 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.97■■■■■ 6.55
Abcc9P70170 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC55.91■■■■■ 6.54
Abcc9P70170 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC55.89■■■■■ 6.54
Abcc9P70170 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC55.85■■■■■ 6.53
Abcc9P70170 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC55.84■■■■■ 6.53
Abcc9P70170 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC55.8■■■■■ 6.52
Abcc9P70170 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC55.78■■■■■ 6.52
Abcc9P70170 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.74■■■■■ 6.51
Abcc9P70170 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.72■■■■■ 6.51
Abcc9P70170 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC55.71■■■■■ 6.51
Abcc9P70170 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC55.71■■■■■ 6.51
Abcc9P70170 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC55.69■■■■■ 6.5
Abcc9P70170 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
Abcc9P70170 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC55.67■■■■■ 6.5
Abcc9P70170 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.67■■■■■ 6.5
Abcc9P70170 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.66■■■■■ 6.5
Abcc9P70170 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.64■■■■■ 6.5
Abcc9P70170 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.64■■■■■ 6.5
Abcc9P70170 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.61■■■■■ 6.49
Abcc9P70170 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.59■■■■■ 6.49
Abcc9P70170 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC55.58■■■■■ 6.49
Abcc9P70170 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.54■■■■■ 6.48
Abcc9P70170 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
Abcc9P70170 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC55.5■■■■■ 6.47
Abcc9P70170 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC55.47■■■■■ 6.47
Abcc9P70170 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.47■■■■■ 6.47
Abcc9P70170 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.41■■■■■ 6.46
Abcc9P70170 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.41■■■■■ 6.46
Abcc9P70170 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.41■■■■■ 6.46
Abcc9P70170 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.4■■■■■ 6.46
Abcc9P70170 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC55.36■■■■■ 6.45
Abcc9P70170 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC55.34■■■■■ 6.45
Abcc9P70170 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
Abcc9P70170 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.29■■■■■ 6.44
Abcc9P70170 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC55.29■■■■■ 6.44
Abcc9P70170 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
Abcc9P70170 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.19■■■■■ 6.43
Abcc9P70170 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
Abcc9P70170 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
Abcc9P70170 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC55.16■■■■■ 6.42
Abcc9P70170 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.16■■■■■ 6.42
Abcc9P70170 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC55.12■■■■■ 6.41
Abcc9P70170 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.11■■■■■ 6.41
Abcc9P70170 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC55.1■■■■■ 6.41
Abcc9P70170 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.1■■■■■ 6.41
Abcc9P70170 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.07■■■■■ 6.41
Abcc9P70170 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC55.06■■■■■ 6.4
Abcc9P70170 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC55.05■■■■■ 6.4
Abcc9P70170 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.02■■■■■ 6.4
Abcc9P70170 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.02■■■■■ 6.4
Abcc9P70170 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
Abcc9P70170 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
Abcc9P70170 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
Abcc9P70170 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
Abcc9P70170 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.96■■■■■ 6.39
Abcc9P70170 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
Abcc9P70170 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC54.93■■■■■ 6.38
Abcc9P70170 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC54.93■■■■■ 6.38
Abcc9P70170 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.91■■■■■ 6.38
Abcc9P70170 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.9■■■■■ 6.38
Abcc9P70170 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC54.9■■■■■ 6.38
Abcc9P70170 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.87■■■■■ 6.37
Abcc9P70170 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC54.85■■■■■ 6.37
Abcc9P70170 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC54.85■■■■■ 6.37
Abcc9P70170 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.84■■■■■ 6.37
Abcc9P70170 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC54.83■■■■■ 6.37
Abcc9P70170 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC54.83■■■■■ 6.37
Abcc9P70170 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
Abcc9P70170 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC54.79■■■■■ 6.36
Abcc9P70170 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC54.79■■■■■ 6.36
Abcc9P70170 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC54.77■■■■■ 6.36
Abcc9P70170 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC54.73■■■■■ 6.35
Abcc9P70170 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC54.71■■■■■ 6.35
Abcc9P70170 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.64■■■■■ 6.34
Abcc9P70170 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC54.58■■■■■ 6.33
Abcc9P70170 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
Abcc9P70170 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC54.54■■■■■ 6.32
Abcc9P70170 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
Abcc9P70170 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.43■■■■■ 6.3
Abcc9P70170 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
Abcc9P70170 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC54.41■■■■■ 6.3
Abcc9P70170 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.4■■■■■ 6.3
Abcc9P70170 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
Abcc9P70170 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
Abcc9P70170 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC54.39■■■■■ 6.3
Abcc9P70170 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
Abcc9P70170 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
Abcc9P70170 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
Abcc9P70170 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.29
Abcc9P70170 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.31■■■■■ 6.28
Abcc9P70170 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
Abcc9P70170 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.28■■■■■ 6.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms