Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bmp8bP55105 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bmp8bP55105 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bmp8bP55105 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bmp8bP55105 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bmp8bP55105 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bmp8bP55105 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Bmp8bP55105 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bmp8bP55105 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bmp8bP55105 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bmp8bP55105 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bmp8bP55105 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bmp8bP55105 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bmp8bP55105 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bmp8bP55105 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bmp8bP55105 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bmp8bP55105 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bmp8bP55105 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bmp8bP55105 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bmp8bP55105 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bmp8bP55105 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bmp8bP55105 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bmp8bP55105 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bmp8bP55105 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bmp8bP55105 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bmp8bP55105 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bmp8bP55105 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bmp8bP55105 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bmp8bP55105 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bmp8bP55105 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bmp8bP55105 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp8bP55105 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bmp8bP55105 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp8bP55105 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp8bP55105 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Bmp8bP55105 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bmp8bP55105 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bmp8bP55105 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bmp8bP55105 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp8bP55105 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms