Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ephb4P54761 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ephb4P54761 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Ephb4P54761 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ephb4P54761 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ephb4P54761 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ephb4P54761 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ephb4P54761 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Ephb4P54761 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ephb4P54761 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ephb4P54761 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ephb4P54761 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ephb4P54761 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Ephb4P54761 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ephb4P54761 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ephb4P54761 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ephb4P54761 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ephb4P54761 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ephb4P54761 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ephb4P54761 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ephb4P54761 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Ephb4P54761 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Ephb4P54761 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ephb4P54761 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ephb4P54761 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ephb4P54761 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Ephb4P54761 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ephb4P54761 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ephb4P54761 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ephb4P54761 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ephb4P54761 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ephb4P54761 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ephb4P54761 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ephb4P54761 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ephb4P54761 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ephb4P54761 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ephb4P54761 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ephb4P54761 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ephb4P54761 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ephb4P54761 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ephb4P54761 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ephb4P54761 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ephb4P54761 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ephb4P54761 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ephb4P54761 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ephb4P54761 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ephb4P54761 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Ephb4P54761 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ephb4P54761 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ephb4P54761 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,2 ms