Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Cux1P53564 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Cux1P53564 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Cux1P53564 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Cux1P53564 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Cux1P53564 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Cux1P53564 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Cux1P53564 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Cux1P53564 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Cux1P53564 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Cux1P53564 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Cux1P53564 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Cux1P53564 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Cux1P53564 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Cux1P53564 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Cux1P53564 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Cux1P53564 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Cux1P53564 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Cux1P53564 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Cux1P53564 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cux1P53564 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Cux1P53564 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Cux1P53564 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Cux1P53564 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Cux1P53564 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Cux1P53564 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Cux1P53564 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Cux1P53564 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Cux1P53564 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
Cux1P53564 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Cux1P53564 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Cux1P53564 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Cux1P53564 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Cux1P53564 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Cux1P53564 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Cux1P53564 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Cux1P53564 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Cux1P53564 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Cux1P53564 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Cux1P53564 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Cux1P53564 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Cux1P53564 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Cux1P53564 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Cux1P53564 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Cux1P53564 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Cux1P53564 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Cux1P53564 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Cux1P53564 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Cux1P53564 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Cux1P53564 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Cux1P53564 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Cux1P53564 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Cux1P53564 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Cux1P53564 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Cux1P53564 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Cux1P53564 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Cux1P53564 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Cux1P53564 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Cux1P53564 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cux1P53564 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Cux1P53564 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cux1P53564 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Cux1P53564 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cux1P53564 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cux1P53564 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Cux1P53564 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cux1P53564 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Cux1P53564 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Cux1P53564 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Cux1P53564 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cux1P53564 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Cux1P53564 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Cux1P53564 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cux1P53564 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Cux1P53564 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Cux1P53564 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cux1P53564 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cux1P53564 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Cux1P53564 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Cux1P53564 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Cux1P53564 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
Cux1P53564 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Cux1P53564 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Cux1P53564 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Cux1P53564 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Cux1P53564 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Cux1P53564 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Cux1P53564 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Cux1P53564 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Cux1P53564 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Cux1P53564 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Cux1P53564 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Cux1P53564 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Cux1P53564 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms