Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aff3P51827 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Aff3P51827 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Aff3P51827 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Aff3P51827 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aff3P51827 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aff3P51827 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aff3P51827 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aff3P51827 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aff3P51827 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aff3P51827 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aff3P51827 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aff3P51827 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aff3P51827 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Aff3P51827 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aff3P51827 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aff3P51827 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aff3P51827 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aff3P51827 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aff3P51827 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aff3P51827 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aff3P51827 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Aff3P51827 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Aff3P51827 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aff3P51827 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aff3P51827 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aff3P51827 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aff3P51827 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Aff3P51827 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Aff3P51827 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Aff3P51827 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aff3P51827 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aff3P51827 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aff3P51827 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aff3P51827 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Aff3P51827 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aff3P51827 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aff3P51827 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aff3P51827 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aff3P51827 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aff3P51827 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aff3P51827 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aff3P51827 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aff3P51827 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aff3P51827 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aff3P51827 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aff3P51827 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aff3P51827 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Aff3P51827 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aff3P51827 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aff3P51827 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aff3P51827 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aff3P51827 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aff3P51827 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aff3P51827 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aff3P51827 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aff3P51827 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aff3P51827 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Aff3P51827 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aff3P51827 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aff3P51827 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aff3P51827 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Aff3P51827 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aff3P51827 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Aff3P51827 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Aff3P51827 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Aff3P51827 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aff3P51827 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aff3P51827 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aff3P51827 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Aff3P51827 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms