Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
HttP42859 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
HttP42859 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
HttP42859 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
HttP42859 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
HttP42859 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
HttP42859 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
HttP42859 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
HttP42859 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
HttP42859 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,92■■■□□ 2,38
HttP42859 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
HttP42859 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
HttP42859 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
HttP42859 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
HttP42859 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
HttP42859 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
HttP42859 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,83■■■□□ 2,37
HttP42859 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
HttP42859 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
HttP42859 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
HttP42859 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
HttP42859 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
HttP42859 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
HttP42859 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
HttP42859 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
HttP42859 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
HttP42859 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
HttP42859 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
HttP42859 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
HttP42859 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,69■■■□□ 2,34
HttP42859 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
HttP42859 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,66■■■□□ 2,34
HttP42859 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
HttP42859 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
HttP42859 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
HttP42859 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
HttP42859 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,58■■■□□ 2,33
HttP42859 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
HttP42859 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
HttP42859 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
HttP42859 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
HttP42859 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
HttP42859 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
HttP42859 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
HttP42859 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,45■■■□□ 2,3
HttP42859 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
HttP42859 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
HttP42859 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,4■■■□□ 2,3
HttP42859 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
HttP42859 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
HttP42859 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
HttP42859 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
HttP42859 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
HttP42859 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
HttP42859 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
HttP42859 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
HttP42859 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
HttP42859 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
HttP42859 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
HttP42859 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
HttP42859 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
HttP42859 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
HttP42859 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
HttP42859 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
HttP42859 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
HttP42859 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
HttP42859 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
HttP42859 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
HttP42859 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
HttP42859 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
HttP42859 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
HttP42859 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
HttP42859 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
HttP42859 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
HttP42859 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
HttP42859 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
HttP42859 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
HttP42859 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
HttP42859 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
HttP42859 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
HttP42859 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
HttP42859 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
HttP42859 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
HttP42859 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
HttP42859 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
HttP42859 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
HttP42859 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
HttP42859 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
HttP42859 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
HttP42859 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
HttP42859 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
HttP42859 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
HttP42859 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
HttP42859 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
HttP42859 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
HttP42859 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
HttP42859 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
HttP42859 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,71■■■□□ 2,19
HttP42859 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
HttP42859 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,5 ms