Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stfa3P35173 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stfa3P35173 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stfa3P35173 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stfa3P35173 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stfa3P35173 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stfa3P35173 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stfa3P35173 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stfa3P35173 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stfa3P35173 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stfa3P35173 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stfa3P35173 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stfa3P35173 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stfa3P35173 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms