Protein–RNA interactions for Protein: P28651

Ca8, Carbonic anhydrase-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca8P28651 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ca8P28651 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Ca8P28651 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ca8P28651 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ca8P28651 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ca8P28651 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ca8P28651 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ca8P28651 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ca8P28651 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Ca8P28651 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ca8P28651 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ca8P28651 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ca8P28651 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ca8P28651 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Ca8P28651 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ca8P28651 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ca8P28651 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ca8P28651 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ca8P28651 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Ca8P28651 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ca8P28651 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ca8P28651 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ca8P28651 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ca8P28651 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ca8P28651 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ca8P28651 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ca8P28651 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ca8P28651 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ca8P28651 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ca8P28651 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ca8P28651 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ca8P28651 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ca8P28651 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ca8P28651 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ca8P28651 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ca8P28651 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ca8P28651 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ca8P28651 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ca8P28651 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ca8P28651 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ca8P28651 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ca8P28651 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ca8P28651 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ca8P28651 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Ca8P28651 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ca8P28651 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Ca8P28651 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ca8P28651 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ca8P28651 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ca8P28651 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ca8P28651 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ca8P28651 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ca8P28651 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ca8P28651 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ca8P28651 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ca8P28651 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ca8P28651 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ca8P28651 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ca8P28651 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ca8P28651 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ca8P28651 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ca8P28651 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ca8P28651 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Ca8P28651 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ca8P28651 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ca8P28651 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ca8P28651 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ca8P28651 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ca8P28651 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ca8P28651 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ca8P28651 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ca8P28651 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ca8P28651 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ca8P28651 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ca8P28651 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ca8P28651 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ca8P28651 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ca8P28651 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ca8P28651 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ca8P28651 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ca8P28651 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ca8P28651 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Ca8P28651 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ca8P28651 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ca8P28651 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ca8P28651 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ca8P28651 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Ca8P28651 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ca8P28651 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ca8P28651 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ca8P28651 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ca8P28651 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ca8P28651 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms