Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Itgb7P26011 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Itgb7P26011 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Itgb7P26011 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Itgb7P26011 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Itgb7P26011 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Itgb7P26011 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Itgb7P26011 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Itgb7P26011 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Itgb7P26011 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Itgb7P26011 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Itgb7P26011 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Itgb7P26011 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Itgb7P26011 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Itgb7P26011 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Itgb7P26011 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Itgb7P26011 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Itgb7P26011 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb7P26011 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb7P26011 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb7P26011 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Itgb7P26011 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Itgb7P26011 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Itgb7P26011 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Itgb7P26011 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Itgb7P26011 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Itgb7P26011 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Itgb7P26011 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Itgb7P26011 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Itgb7P26011 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Itgb7P26011 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Itgb7P26011 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Itgb7P26011 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Itgb7P26011 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Itgb7P26011 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Itgb7P26011 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Itgb7P26011 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Itgb7P26011 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Itgb7P26011 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Itgb7P26011 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Itgb7P26011 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Itgb7P26011 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Itgb7P26011 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Itgb7P26011 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Itgb7P26011 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Itgb7P26011 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Itgb7P26011 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Itgb7P26011 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Itgb7P26011 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Itgb7P26011 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Itgb7P26011 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Itgb7P26011 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Itgb7P26011 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Itgb7P26011 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Itgb7P26011 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Itgb7P26011 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Itgb7P26011 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Itgb7P26011 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Itgb7P26011 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Itgb7P26011 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Itgb7P26011 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Itgb7P26011 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Itgb7P26011 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Itgb7P26011 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Itgb7P26011 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Itgb7P26011 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Itgb7P26011 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Itgb7P26011 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Itgb7P26011 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Itgb7P26011 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Itgb7P26011 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Itgb7P26011 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Itgb7P26011 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Itgb7P26011 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Itgb7P26011 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Itgb7P26011 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Itgb7P26011 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Itgb7P26011 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Itgb7P26011 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Itgb7P26011 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Itgb7P26011 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Itgb7P26011 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms